南山學(xué)院為廣東省高等學(xué)校試點(diǎn)學(xué)院、廣東省高等學(xué)校拔尖創(chuàng)新人才培養(yǎng)項(xiàng)目，下設(shè)臨床醫(yī)學(xué)專業(yè)統(tǒng)籌實(shí)驗(yàn)班（簡(jiǎn)稱“南山班”）。南山班2010年經(jīng)教育部批準(zhǔn)成立，由“共和國(guó)勛章”獲得者鐘南山院士擔(dān)任班主任，實(shí)施“三制三化三融合”人才培養(yǎng)模式改革，培養(yǎng)具有持續(xù)發(fā)展能力的拔尖創(chuàng)新醫(yī)學(xué)人才。

金域檢驗(yàn)學(xué)院是國(guó)家首批現(xiàn)代產(chǎn)業(yè)學(xué)院。學(xué)院構(gòu)建產(chǎn)學(xué)研一體化的校企協(xié)同育人模式，打造與國(guó)際接軌的校企院教學(xué)和科研平臺(tái)，實(shí)行全程導(dǎo)師制，配套校企協(xié)同人才培養(yǎng)方案，培養(yǎng)具有崗位勝任能力及醫(yī)學(xué)研究能力的高素質(zhì)應(yīng)用型醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)人才。

藥學(xué)卓越班是廣東省創(chuàng)新強(qiáng)校工程項(xiàng)目“藥學(xué)專業(yè)綜合改革試點(diǎn)”，依托藥學(xué)復(fù)合型人才培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)區(qū)平臺(tái)，以個(gè)性化培養(yǎng)的一對(duì)一導(dǎo)師制為特色，培養(yǎng)具有國(guó)際視野并適應(yīng)粵港澳大灣區(qū)生物醫(yī)藥需求的拔尖創(chuàng)新人才。目前已與境外多所高校（香港中文大學(xué)、香港浸會(huì)大學(xué)、英國(guó)伯明翰大學(xué)、美國(guó)圣約翰大學(xué)）開展了夏令營(yíng)等聯(lián)合人才培養(yǎng)，與圣約翰大學(xué)簽署了“4+2”本碩一體化人才培養(yǎng)合作協(xié)議。

生物技術(shù)卓越班由廣州醫(yī)科大學(xué)-中國(guó)科學(xué)院廣州生物醫(yī)藥與健康研究院聯(lián)合共建，以醫(yī)理交叉融合為培養(yǎng)特色，構(gòu)建校院協(xié)同育人培養(yǎng)模式，實(shí)行個(gè)性化教育，培養(yǎng)契合粵港澳大灣區(qū)建設(shè)需求，掌握醫(yī)學(xué)知識(shí)、生物技術(shù)前沿理論和產(chǎn)業(yè)動(dòng)態(tài)，具有科學(xué)研究和創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)能力的高素質(zhì)生物技術(shù)卓越人才。

基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)拔尖創(chuàng)新班 依托呼吸疾病國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室等國(guó)家級(jí)科研平臺(tái)，以“基礎(chǔ)-臨床貫通融合、醫(yī)工文理多學(xué)科交叉”為特色，采取“5+5”本-碩博兩段式培養(yǎng)模式，實(shí)施“一對(duì)一”導(dǎo)師制下的精英化教育，科教協(xié)同，培養(yǎng)具有扎實(shí)的醫(yī)學(xué)和生命科學(xué)理論基礎(chǔ)及卓越的創(chuàng)新實(shí)踐能力、滿足未來高等醫(yī)學(xué)教育及國(guó)家醫(yī)學(xué)科技創(chuàng)新重大需求的拔尖人才。