學校“2011計劃”創新實驗區依托長三角綠色制藥協同創新中心和藥學院，通過設立協同培養協調機構、重組優化培養方案、強化師資力量，積極培養具有國際從業競爭力的創新人才和企業需求的拔尖技術創新人才，實驗區以藥學類專業直接招生，內設制藥工程（“2011計劃”創新實驗班），實驗班面向藥學類專業錄取的浙江省考生進行選拔，高考投檔成績在藥學類專業錄取考生前20名且英語成績110分（含）以上考生，免面試選拔環節可直接進入制藥工程（“2011”計劃創新實驗班），實驗班學生培養實行動態調整機制。非藥學類專業錄取的考生，學習成績優異的可在第二、三、四學期通過轉專業向綠色制藥協同創新中心提出申請。